第一章 总 则
第一条为指导和规范重大科研项目专项审计工作，提升审计工作质量，根据《中国科学院内部审计工作规定》《中国科学院抢占科技制高点攻坚专项管理办法（试行）》《中国科学院战略性先导科技专项管理办法》等有关要求，结合审计实际，制定本指引。
第二条本指引适用于中国科学院抢占科技制高点攻坚专项、战略性先导科技专项等专项，其他科研项目可参考使用。
第三条 专项审计聚焦院部署重大科研任务，以促进规范管理、防范重大风险为目标，对专项经费管理与使用情况进行审计。
第二章 整体审计策略
第四条 结合专项总体目标及科研特点，按照专项、项目、课题、子课题（子任务）等层级进行审计。
第五条 专项和项目等非末级关注科研项目管理，包括专项任务调整、预算调整与资金分配、科技成果管理等，重点关注程序的合规性以及存在的风险；课题等末级关注经费的管理与使用，按照预算科目和财务核算科目相结合的原则，分类对科研经济业务进行审计，重点关注科研经济业务的真实性、合法性和合规性。
第六条审计内容包括但不限于:
（一）专项组织管理：专项各层级设置及任务分解情况，变更、撤销、终止等调整情况，撤销或变更相关账目与资产清理等情况。
（二）预算管理、资金到位和转拨：专项各层级预算的编制、分配、到位、调剂、执行、转拨情况。
（三）经费使用：科研经济业务及支出（含实施准备期支出）的真实性、合法性、合规性、相关性和效益性。
（四）科技成果管理：知识产权的申请、维护、使用和保护，科技成果的转化、应用等。
第七条在对单位进行审计抽样时，专项依托单位和项目承担单位应全覆盖，课题承担单位可视情况进行抽样。
第八条在对经费进行审计抽样时，一般采取判断抽样和分层抽样相结合的方式，对科研经费支出结构进行分析，对重要科研经济业务全覆盖，常规科研经济业务抽样率不低于60%，具体需结合控制测试结果确定。
第三章 审前准备
第九条 审前调查
审计组在开展审计前，需进行审前调查，了解项目适用的相关法律法规及其他规定、单位内部制度，对国家科研资金管理政策的落实情况，科研团队及科研财务助理基本情况，课题独立核算情况，其他审计和检查情况，项目立项及实施情况、组织管理体制、概预算编制与审批、任务调整、预算执行与调剂、预算分配、经费到位、经费支出、科技成果等。
审前调查一般针对审计重点，采取审阅法、访谈法和外部信息调阅法等方法。
审计组通过对审前调查了解到的情况进行综合研判分析，突出问题和风险导向，明确审计重点，制定有针对性的审计实施方案，指导现场审计工作开展。
第十条审计资料
审计组实施审计前，向专项办公室获取以下审计资料：
专项各级承担单位分别提供一个具有最高查询权限的ARP账号（院内单位），OA系统账号；
专项各级承担单位审计对接人员清单及联系方式；
专项组织管理机构及职责；
专项立项通知，各层级任务书；
专项各层级年度工作计划及经费预算书;
各级承担单位各类人员执行期内各年度花名册（院内单位）；
各级承担单位实际参与的成员名单及其兼职资料，科研财务助理名单；
专项制定的适用本专项的科研组织、资金、队伍、知识产权、档案、专家选取、人员管理等管理制度；
与专项相关的项目管理和资金使用的内部管理制度；
专项各层级年度工作报告、年度经费使用报告等；
专项工作会议、总体组会议等各类会议纪要；
专项研究目标、考核指标、技术路线、实施周期、各级负责人等变更调整审批资料；
专项各层级延期或终止等批复或备案资料，预算调剂资料；
专项阶段考核专家组意见、过程管理报告、资金使用情况报告、档案工作建议等阶段考核资料；
专项各层级结题报告、结题审计报告、绩效报告等验收资料；
专项各层级经费到位及转拨资料；
专项各层级信息一览表，内容包括任务层级、编号、名称、承担单位、负责人、各年直接费用及间接费用批复预算、各年直接费用及间接费用调剂后预算、各年直接费用及间接费用到位、直接费用总支出、间接费用总支出、预算执行率、填报人及联系方式等；
专项最末层级的直接费用支出明细账及其会计凭证，间接费用管理规则、核算账号、支出明细账；
从专项层级角度和科研经济业务类型角度列示的经费支出明细表，内容包括任务层级、编号、名称、承担单位、负责人、各类直接费用、间接费用、填报人及联系方式等；
ARP系统（院外单位为财务资产系统）导出的固定资产明细表或卡片；
资产或服务的采购申请、招投标或询比价、验收等采购全流程相关资料；
专项年度监理实施计划及工作重点、监理报告、监理会议纪要等有关监理资料，对监理提出问题的整改资料等；
科技成果资料，如知识产权、论文等；
接受各类审计和检查的报告等资料；
专项（预）归档目录；
其他审计需要的资料。
第四章 内部控制测试
第十一条 一般要求
内部控制测试一般按照资金投入、使用和管理涉及到的具体业务类型开展，评价重大科研项目内部控制设计的合理性和运行的有效性。
第十二条了解专项各层级相关具体业务流程，确定违规可能发生的环节及控制目标，了解和识别单位采用的相关控制措施，关注是否存在问题或薄弱环节；执行内部控制测试，测试相关控制运行的有效性，关注是否存在执行不到位的情况。
根据内部控制测试结果，确定或修改实质性程序的性质、时间和范围。
第五章 实质性程序
第十三条 专项组织管理
检查专项组织管理机构是否健全，是否实际履行职责。
检查专项是否按照院管理办法要求，结合自身特点和工作需要，建立科研组织、资金、队伍、知识产权、档案等管理制度。
检查专项是否按规定执行年度计划、交流、报告、考核等管理机制。
检查年度工作报告、监理报告、会议纪要等与任务执行情况相关的资料，分析专项是否根据任务书确定的目标任务和工作计划执行，关注是否存在拖期、滞后现象，任务调整、变更、撤销、终止是否按规定进行备案审批；撤销或终止相关账目与资产清理程序是否合规、是否存在异常情况，并就异常情况进行核实。
检查核算账号清单，关注核算账号设置是否符合规定，是否随意拆分课题，课题设置数量是否超出规定。
第十四条 预算管理
对比任务书与预算，关注预算编制与实际研究内容是否相符，是否编报虚假预算套取财政资金，是否结余过大仍超前申请预算造成资金闲置浪费等。
检查预算执行情况，尤其是每年底支出情况，关注预算执行率与研究进度是否匹配，了解并分析预算执行率较低、存在大量结转资金的原因，关注异常情况并核实。
任务发生调整、变更的，了解是否涉及经费变化，关注经费变化是否与任务变化相符。
检查预算调剂相关资料，关注是否按规定进行备案审批，预算调剂依据是否充分、与研究内容是否匹配。
关注是否虚假承诺其他来源资金，其他来源资金是否足额到位，来源渠道是否合规等。
第十五条资金到位和资金转拨
检查任务书、预算调剂、经费转拨资料，关注资金到位和转拨情况如单位、时间、金额等是否符合任务书要求，是否预算外转拨经费尤其是向院外参与单位拨付间接费用，是否无理由延期拨付影响项目开展。
第十六条 经费使用
直接费用通用审计程序：
检查支出发生原始资料，与任务书、预算书进行对比，了解科研业务特点及研究方法，了解支出尤其是设备费、材料费、委托业务费与预算不符的原因，关注以下内容：
关注支出是否真实发生，如虚假合同、虚假票据、虚构事项、虚报人员等。
关注支出是否与工作相关，如，列支应由个人负担的因私旅行、私人用图书资料等支出和各种罚款、捐款、赞助、投资或偿还债务等支出。
关注支出是否与任务直接相关，如，其他科研项目的预研支出，实际用于横向科研项目或基建项目的支出，超过正常需要量的材料等支出，日常运行的水、电、气、暖等支出，与任务不直接相关的预算外专业图书资料支出，与任务不直接相关的预算外用于日常办公的设备、耗材、操作系统、软件、普通通讯费、普通网络费等支出，非本任务形成专利的申请和维护支出，非本任务形成论文的版面费和审稿费，研究生论文复印、打印、装订费和答辩评审费，发生在执行期外（合同尾款可在执行期后）且无合理理由的支出等。
关注支出是否符合规定的经费列支范围，如，列支在编人员绩效奖励以外的工资、招待费、不在规定范围内的论文润色/修改/翻译费等。
梳理临近结束期报销和发生的支出，与任务执行进度进行对比，关注异常情况如按照进度应先行采购的设备在临近结束期才到货、以拨代支等，并核实。
关注零余额账户资金与银行存款账户资金是否混用；关注支出结算是否按照公务卡有关规定执行；检查非银行转账方式结算的支出，与具体科研经济业务分类审计程序相结合，关注异常情况并核实。
分类审计程序：
（一）设备费和材料费
1.关注固定资产明细表或卡片与明细账是否相符；关注预算外设备支出是否按规定进行备案审批。
2.检查设备采购、设备租赁、材料采购的申请、论证、审批、招标或比选、合同、发票、付款、验收、使用等全流程资料，结合科研业务内容、进展、实验记录等信息，并与本课题同类业务做纵向对比、与专项其他同类业务做横向对比，分析资料是否齐全，单位名称、设备名称和规格型号、设备数量等信息是否相互勾稽一致，关注异常情况如假发票、时间不符合逻辑顺序、资金实际流向与开具发票单位和合同签订单位不一致、合同条款不合常理、评分标准或评标过程不合常理、投标文件雷同、用复印件代替原件、验收图片重复、同一供应商提供明显不同领域的产品、报销应由对方公司承担的费用、同一业务重复付款等，并核实。
3.检查设备采购、设备租赁、材料采购的采购方式是否符合国家及院相关规定，采购程序是否合规，是否存在业务拆分、应招未招、串标围标等；检查进口设备采购程序是否合法、合规。
4.查询供应商工商信息，关注供应商是否具备相关资质和能力，是否存在经营异常事项并核实，投标或比选单位是否存在关联关系、管理关系或利害关系等。
5.通过各种渠道如本课题及本专项其他同类业务价格、网上商城报价、电话询价等，获取价格信息，关注设备采购、设备租赁、材料采购的价格是否明显虚高；进口设备代理费、运杂费等是否符合行业规则等。必要时可邀请行业专家进行咨询。
6.关注是否对购入设备、租赁设备、符合使用条件的试制设备、材料办理验收和交付使用手续。
7.检查材料费、委托业务费等支出，关注符合固定资产确认条件的资产是否准确计量和记录。
8.实地查看、盘点设备和仍有结存的材料，尤其是异地资产的管理和使用，关注是否重复购置资产，资产是否闲置或使用效率低下等。
（二）委托业务费
1.了解委托业务内容，关注是否以委托业务费名义违规转拨经费；是否以测试化验加工费的名义转包科研任务；是否在单位内部具备相关资质能力的情况下仍委托外部单位且无合理理由；如果任务内容为软件开发，关注单位是否以定制或购买软件的形式变相将任务整体外包。
2.参考（一）设备费和材料费第2点，并额外检查检验、测试、化验、加工服务结果报告或分析测试报告等成果性资料，分析成果性资料是否雷同、是否符合合同约定等，并核实；关注委托业务的必要性等。
3.参考（一）设备费和材料费第3、4、5、6点，检查采购方式的合规性、供应商资质的充分性、委托价格的合理性、验收程序的合规性。
4.检查材料费、委托业务费等支出，关注符合无形资产确认条件的资产是否准确计量和记录。
5.实地查看、盘点形成资产的委托业务，关注是否可以正常运行，是否闲置或使用效率低下等。对尚未完成的委托业务，必要时可到受托单位实地查看委托业务进展情况。
6.检查支付给内部独立核算部门的检验、测试、化验及加工等支出，了解内部委托全流程，核对经费支出与相关仪器设备使用记录，关注内部结算价格是否符合成本补偿原则，是否通过虚转经费转变资金性质等。
（三）燃料动力费
检查燃料动力费分摊相关资料，与相关仪器设备功率等指标进行对比测算，关注分摊依据和分摊金额是否合理。
（四）会议费/差旅费/国际合作与交流费
1.检查差旅相关资料如出差申请审批单、报销单、发票、邀请函、通知、日程、会议纪要或总结报告等，尤其是涉及到自驾和租车的，与考勤记录、门禁记录、食堂消费记录、本人其他出差行程、本人其他市内打车票、个人刷卡消费记录等进行对比，关注异常情况如日期重合、城市间交通票为单程、未发生住宿费用、车牌号为异地、汽油费和路桥费地址与路线不一致、用现金结算等，并核实；关注是否变相旅游、虚增人数和天数、虚开或低价高开航空行程单、无合理理由采用非政采方式购买机票、向代理机构支付机票订票费、租车价格虚高、超租车合同付款、租车公司和司机无资质、夹带报销汽油费和路桥费、重复领取或超标准领取伙食交通补助和住宿包干补助、二次分配出差补助、未经批准超标准乘坐交通工具等。
2.检查会议举办情况，网上查询相关报道，关注预算、会期、地点、公示、收费、结算方式等是否符合规定，是否存在超范围、超标准支出，是否存在虚增人数和天数规避超标的情况，是否违反八项规定精神如安排宴请、购买烟酒、提供高档菜肴、借会议大吃大喝、转嫁招待费、违规购置礼品、安排无关参观、安排高消费娱乐和健身活动等，委托办会的会议服务公司是否具备相关资质、结算资料是否与实际情况相符等。
3.检查来华访问情况，关注是否存在超范围、超标准支出等，适当关注与项目开展是否有实质性关联。
4.检查因公出国（境）情况，实际出国（境）人员、时间、地点等是否与其他相关资料一致，关注审批、事前公示、事后公开、证件管理等是否符合规定，是否存在超范围、超批件、超标准支出等。
（五）劳务费
1.检查学生劳务费发放情况，分析发放规律或波动情况等，关注日期、金额、人员等相关信息的异常情况并核实。
2.检查劳务聘用合同、劳务派遣及聘用协议等劳务性支出资料，网上查询劳务派遣公司资质等情况，分析劳务派遣和临聘人员劳务费发放规律或波动情况，将同类劳务事项相关信息进行纵向和横向对比，分析劳务内容、日期、金额、人员等相关信息的异常情况，如劳务人员身份、年龄、户籍地与任务相比不合常理或逻辑、同类劳务发放标准差异较大等并核实；关注是否存在超范围支出如在编人员工资等；劳务派遣公司是否具备劳务派遣资质；涉及到野外的，与野外科考日志等资料进行对比，关注异常情况并核实。
3.网上查询相关报道，与相关会议、培训、差旅等信息进行对比，关注专家咨询内容、时间、地点支持性证据的异常情况如发放时长与相关会议会期不一致等并核实；关注专家咨询费发放是否符合国家相关标准，是否向本单位管理人员、参与本项目研究和管理的人员支付专家咨询费，是否发放上级部门已经支付过的监理专家咨询费等。
4.检查劳务费发放方式是否符合相关要求，原则上应通过银行转账方式；对比签领笔迹，抽查询问领取人，关注是否存在问题或风险如二次分配等。
（六）奖励经费
关注直接费用中提取人员绩效奖励是否超过20%，奖励经费的使用范围和标准是否按规定在单位内部进行公示等。
（七）间接费用
1.关注间接费用和院外单位管理费用核定比例、实际拨付比例是否符合院管理办法规定。
2.检查间接费用使用情况，关注支出或提取金额是否超过预算金额，是否在直接费用重复提取或列支相关费用等。
第十七条了解供应商是否与被审计单位及项目组成员存在关联关系、管理关系或利害关系等，对关联业务进行全覆盖，重点关注异常情况如频繁采购业务、异常供应商（新设立、资质异常、已注销等）采购业务、采购价格异常等，并核实；关注关联业务是否按《中国科学院关于加强科研项目关联业务管理的暂行规定》要求履行申报、论证、审批、公示等程序；是否存在利益输送；是否虚构业务或虚增价格套取专项经费。
第十八条 关注相关科研人员兼职是否符合相关规定，如，是否履行审批或备案、公示程序，是否建立台账并予以公开，是否按规定签订兼职协议，兼职协议是否约定了工作内容、期限、保密、知识产权归属等，兼职产生的知识产权权属是否清晰，兼职时间是否符合要求等。
第十九条科技成果管理
检查任务书、工作总结报告、实验测试报告等资料，了解任务完成情况，科研样机、软件等科研产品的测试情况，适当关注科技成果是否按照任务书确定的指标完成。
了解各级负责人名下科研项目清单、前期相关科技成果，以及各种总结报告中提到的科技成果，检查并对比本专项列支的出版/文献/信息传播/知识产权事务支出相关情况，如合同、发票、验收、领用、专利权证书或申报受理函件、网上知识产权查询信息等，适当关注科技成果是否为已有成果，关注论文润色/修改/翻译费是否必要且符合规定列支范围，论文发表期刊是否符合规定范围，大额论文发表费用支出是否经过决策程序，论文收稿时间是否在本项目研制周期内的合理时间段，是否按规定标注资助来源，符合无形资产确认条件的资产是否准确计量和记录等。
检查任务书、共同申请专项的合作协议、外协支出相关合同、兼职等资料，关注科技成果相关条款是否合理，是否明确约定知识产权归属和转化收益分配，是否存在国有资产流失风险等。
网上查询知识产权申请情况，关注外协单位是否违反合同约定申请知识产权等。
第六章 附 则
第二十条关于重大科研项目专项审计中涉及到的审计项目管理，参照《中国科学院研究所内部审计工作指南》执行；关于具体技术方法，参照《中国科学院科研经济业务真实性合法性审计实务指南》《中国科学院采购与外协业务专项审计指引（试行）》《中央财政科技计划项目（课题）结题审计指引》执行。
第二十一条本指引不可能涵盖实际工作中的所有情况，在开展审计工作时，需结合具体情况和最新的法律法规政策要求，作出相应的选择和调整。
第二十二条本指引由中国科学院监督与审计局负责解释。
附件：***专项审计报告（模板）
附件
***专项审计报告
根据《***审计的通知》，监督与审计局派出审计组，于**年*月*日至**年*月*日对***“***专项”**年*月*日（以下简称“期初”）至**年*月*日（以下简称“期末”）的经费管理与使用情况进行了专项审计。本次审计的依据是《中国科学院内部审计工作规划（2024-2027年）》（科发党字〔2024〕48号）、《中国科学院内部审计工作规定》（科发党字〔2020〕53号）等。现将审计情况报告如下：
一、基本情况
（一）立项情况
（二）任务分解情况
可另外附表作为附件。
（三）任务调整情况
二、组织管理情况
（一）制度建设
（二）组织管理
三、资金管理和使用情况
（一）预算安排情况
（二）资金到位与拨付情况
（三）资金使用情况
可另外附表作为附件。
四、审计发现的主要问题
五、审计建议
（一）
（二）
……
本次审计发现的问题、依据和建议详见附件1。**所应组织有关单位和部门，切实抓好审计发现问题的整改，建章立制，堵塞漏洞。其中，对立行立改问题，应在收到报告之日起60日内完成整改；对分阶段整改问题，第一阶段在收到审计报告之日起60日内制定整改方案，第二阶段在收到审计报告之日起1年内完成整改；对持续整改问题，应在收到报告之日起5年内完成整改，并制定整改时间表、路线图，将整改目标细化分解至年度整改任务，并有序推进。（不涉及的整改类型的相关描述可以删除）
附件：审计发现问题情况表
序号 |
问题在报告中的序号 |
问题发生单位 |
问题标题 |
问题金额 （万元） |
定性依据 |
意见建议 |
整改 类型 |
1 |
（一）1 |
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2 |
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3 |
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注：整改类型选择“立行立改”、“分阶段整改”或“持续整改”。
